在紛亂嘈雜的現代化城市——東京，蔓延著一種外表和人類一樣但是靠吃人肉維生的生物，人們稱之為喰種。故事發生3年後，真戶曉已經晉陞為上等搜查官，而此時的庫因克技術得以發展，作為CCG的最新戰力，庫因克斯出現了，而曉成為了庫因克斯班的班主任。